云南省茶深加工工程技术研究中心是云南省科技厅2010年第二批认定的云南省工程技术研究中心，由云南农业大学和普洱茶研究院共同申报。在2012年12月，云南省茶深加工工程技术研究中心通过省科技厅验收，完成中心的建设。、

中心专注于国际茶功效科学技术领域的研究前沿，研究茶叶功效与健康功能，以茶叶成分与健康功效的关系为核心，开展茶（尤其是普洱茶）因子结构与应用基础研究，探索茶因子的功效及其调节代谢免疫的作用机理，并在此基础上研发新产品、新技术，构建茶因子功效的学科体系。是集研究、设计、开发、成果转让、技术咨询、信息传播、教育培训等工作于一体的综合科研、设计与产业开发机构。

目前中心直接从事研发人员102人，包括教授11人（占比10.78%），兼职教授3人（占比2.94%），副教授18人（占比17.65%），讲师18人（占比17.65%），在读博士研究生10名（占比9.80%），硕士研究生32人（占比31.37%），本科生10人（占比9.80%）。

中心具备良好的科研设施和仪器设备等实验条件，实验室面积达1000平方米以上，科研仪器总价值（原值）超过1000万元。其中50万元以上设备7台套，10-50万元设备达10台套以上，且已加盟云南省大型科研仪器开放共享管理平台（实验室大型仪器设备向全社会提供开放共享服务），包括比较齐全的的生理学和分子生物学实验的仪器设备和技术方法，具备免疫、肿瘤、炎症、代谢、生物化学的研究平台。实验室除拥有常规分子生物学、生物化学、免疫学研究设备外，还拥有流式细胞仪（BD FACSJazz）、荧光显微相关设备、生物发光检测仪、GE Ettan IPGphor 3双向电泳系统、ABI 7900HT荧光定量PCR仪、生物大分子计算模拟平台、生物分子相互作用仪（BiaCore S200）、微量量热仪（MicroCal ITC200、Manual Vp-cap DSC）以及动物实验室等研究设备和平台。此外，中心先后建立了茶深加工产品开发技术平台、茶保健食品研发与示范平台和茶保健食品安全性评价平台

近年来，针对普洱茶健康功效缺乏科学依据、产业链短等制约普洱茶产业发展的关键技术问题，开展了系统研究，取得了重要技术创新：（1）阐明普洱茶抗炎、降糖、降脂等功效及其作用机制，为普洱茶的健康功效与市场应用提供了科学依据；（2）阐明普洱茶降低炎症的分子机制，确证Notch是普洱茶中EGCG抗炎作用的靶点；（3）开发了系列深加工产品，拓展了产业链，并针对普洱茶特定功效提出了饮用方法和饮用量，为普洱茶的市场开发提供了科学数据。