近期,理学院化学系与昆明植物研究所王跃虎研究团队合作的研究论文《Exploring the Frontier of Cyclic Dipeptides: A Bioinformatics Approach to Potential Therapeutic Applications in Schizophrenia》发表在《International Journal of Molecular Sciences》(JCR Q1 TOP,IF4.9),2020级化学生物学本科专业学生农学祥与指导教师李兴玉教授为共同第一作者,昆明植物所王跃虎研究员为通讯作者。此外,杨珺、李旻玥、王秋玲、孙敏、马琪琛、徐玲等老师和同学也参与该研究。这是我院与科研部门联合指导本科学生发表的一篇高质量研究论文,是我院科研反哺教学,不断提高人才培养质量的又一突破。
该论文通过综合运用文献计量、网络药理学、GEO数据挖掘、分子对接以及生物学实验等多种分析手段,探讨了环二肽(Cyclic Dipeptides, CDPs)在精神类疾病,特别是精神分裂症治疗方面的潜在应用价值。研究通过网络药理分析、基因差异表达分析和分子对接,评估了CDPs对多种精神分裂症蛋白靶标的亲和性,最终筛选出与CDPs具有高亲和性的SIGMA1受体。
SIGMA1受体是由三个相同亚基组成的膜蛋白,其膜外部分通过β折叠形成一个活性口袋。研究发现,CDPs在该活性口袋中表现出较高的亲和性,并能够与口袋中的TYR-103、TYR-20、THR-60、SER-117、ASP-126等氨基酸残基形成氢键。此外,通过细胞毒性实验验证了环(丙-谷)氨酸(IC50=13.4 μM)、环(丙-组)氨酸(IC50=19.4 μM)及环(缬-甘)氨酸(IC50=11.5 μM)对SIGMA1受体的良好抑制活性。
该篇文章以农学祥的本科毕业论文为基础,在导师和团队的悉心指导下共同完成。农学祥同学取得优异成绩是学院全体老师协同育人的成果。